Jest doskonałym źródłem cennych białek. Nie zawiera glutenu, dlatego w przepisach na wypieki należy stosować ją wyłącznie jako dodatek – zazwyczaj dodaje się ją jednak do mąki pszennej. Soja jest zasadotwórcza i ma wysoką zawartość witamin B1 i B3, lecytyny, wapnia oraz magnezu. Lecytyna sojowa działa jak emulgator, czyli tak samo jak lecytyna zawarta w jajkach. Dodając 3-5% mąki sojowej do wypieków, możemy zastąpić jajka i znacząco wydłużyć ich trwałość. Mąkę sojową gładką możemy również wykorzystać do zagęszczania zup i sosów.

Czarna soja ma słodki smak, wpływa na śledzionę i nerki oraz jest neutralna. Porusza krew, usuwa wiatr, oczyszcza gorąco, nawilża. Jest odpowiednia przy wzdęciach, chorobach skóry oraz reumatyzmie.

Żółta soja ma słodki smak, wpływa na żołądek, śledzionę i jelito grube. Jej natura jest neutralna do ciepłej. Nawilża i detoksykuje, pomaga przy obrzękach i braku apetytu. Nie powinna być spożywana w dużych ilościach, ponieważ wtedy w organizmie tworzyłaby się wilgoć i śluz.